Rencontre de la chaire du 22 septembre 2021 au Museum National d'Histoire Naturelle dans la Salle de Géologie Plan d'accès.
Programme :
- 10h-10h40 : Thomas Cortier (Sorbonne Université) - Implications de l’évolution des phénologies pour l’émergence et le maintien de la diversité.
Résumé : La phénologie d’une espèce correspond aux successions périodiques des différentes étapes de leur cycle de vie, au rythme des saisons. Les changements environnementaux actuels modifient la fenêtre temporelle environnementale favorable à la phénologie de nombreuses espèces. À l'échelle des communautés, ces changements pourraient favoriser le recouvrement des phénologies, donc augmenter la co-occurence des espèces et changer les interactions interspécifiques (compétition...). En utilisant un modèle de co-évolution des phénologies en compétition, on s'intéressera à l'émergence de la diversité et comment les phénologies se distribuent dans l’année. Le lien entre les patterns produits par le modèle et les données de terrain sera discuté. Dans un second temps, l'application d'un changement progressif des conditions environnementales permettra de discuter comment l'évolution peut ou non aider le maintien de la diversité face aux changements environnementaux (sauvetage évolutif).
- 10h45-11h25 : Chi Tran (Univ. Gustave Eiffel) - Dynamique des lignées dans un modèle "simple" d'adaptation à des changements environnementaux".
Résumé : Un modèle aléatoire individu-centré avec naissances, mutations, compétition et morts est proposé pour décrire l'adaptation d'une population à un environnement changeant. Les mutations peuvent être modélisées par un processus de saut ou une diffusion. A l'aide de processus historiques, nous décrivons l'évolution, lorsque t varie, des trajectoires ancestrales des individus vivants au temps t. Ceci nous permet de comprendre d'où vient la diversité présente. Lorsque nous retournons ces lignées en temps, nous montrons qu'elles vérifient des EDS homogènes en temps.
Travail joint avec Vincent Calvez, Benoît Henry et Sylvie Méléard.
- 11h25-11h45 : PAUSE
- 11h45-12h25 : Sarah Kaakai (Univ. du Mans) - IBMPopSim: an R package for the efficient simulation of individual-based population models. Slides, exemple
Résumé : Joint work with D. Giorgi and V. Lemaire (LPSM, Sorbonne Université). The IBMPopSim package (https://daphnegiorgi.github.io/IBMPopSim/) aims at simulating the random evolution of stochastic Individual-Based population Models (IBMs). Such models have applications in various fields including actuarial sciences, biology, demography, or ecology. The package allows users to simulate population in which individuals are characterized by their age and some characteristics, and where the population is modified by different types of events including births/arrivals, death/exit events, or changes of characteristics. The frequency at which an event can occur to an individual can depend on his age and characteristics, on other individuals’ characteristics (interactions), and can be modified over time. IBMPopSim overcomes the limitations of time consuming IBMs simulations by implementing efficient algorithms based on thinning methods. A wide range of models to be implemented, while being user-friendly thanks to its structure based on simple building blocks. In this presentation, I will first give a quick overview of the simulation algorithms, and then propose an illustration based on two examples.
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